NGS宏基因组测序与生信分析服务
宏基因组测序(Metagenomics),又称元基因组学。采用高通量测序技术(NGS),获得环境微生物基因组信息总和,再根据生信分析快速、全面地研究各种生态环境中的微生物群结构、物种分类、系统进化、基因功能以及代谢通路。
传统微生物研究需建立在培养的基础上,但很多微生物无法很好地分离培养,宏基因组测序的研究方法克服了传统培养技术的不足,利用分子生物学来研究微生物群的结构和群体基因组成及功能,能提供更广更深的研究可能性;例如,进一步发掘和研究具有应用价值的基因及环境中微生物群落内部、微生物与环境间的相互关系。目前,宏基因组测序在肠道微生物菌群研究上已有广泛的应用。
纳全生物宏基因测序分析服务,旨在满足用户mNGS测序和生信分析需求,提供简便的服务流程和高质量的测序数据和专业的生信分析报告。用户只需送样,即可轻松完成研究数据需求。
服务三大内容
用户可以寄送符合要求的原始样本或提取后的DNA样本进行测序,纳全接收到用户样本后,展开相应的测序分析流程,并在完成后形成覆盖完整测序流程的项目报告交付用户。交付报告后,纳全仍提供相关的技术支持。
送样建议
样本类型 | 人粪便 | 小鼠粪便 | 唾液 | 肠道内容物 | 口轻/皮肤 |
原始样本 | 1~3g | 3~5粒 | 2~5ml | 液体3~5ml 固体1~3g | 2~3根棉拭子 |
提取样本 | DNA:总量150ng,浓度2ng/uL,体积30pL,避免DNA反复冻融,以免DNA降解 | ||||
平台选择 | illumina PE 150 | ||||
推荐测序量 | 6G-12G clean data/样 | ||||
分析策略 | 1) reads mapping ,2) 序列组装 基因预测,3) binning |
纳全测序服务特点
1、服务流程便捷,通过官方网站、小程序等渠道咨询,发起需求,即刻获得一对一的技术专员与用户对接,根据用户测序目的、研究课题等提供专业测序建议。
2、高质量测序数据,illumina PE 150平台,有效数据含量高,高保真序列信息。
3、样本需求量低,常规宏基因组建库建议样本量在500纳克以上;对于样本获取困难的样本,也可以选择微量建库,纳全宏基因组服务DNA样本建议总量150纳克。
宏基因组测序的应用:
1、微生物多样性研究: 通过宏基因组测序,可以全面了解微生物群的多样性,包括不同物种的存在与相对丰度。
2、功能分析: 除了多样性,我们还能揭示微生物群落的功能特点,包括代谢途径、基因表达和生态角色。
3、环境监测:用于监测环境中的微生物污染、生态系统健康状况等,可用于水质、土壤和空气样品等多种环境类型。
4、疾病研究: 用于肠道微生物研究以及疾病相关微生物研究,如肠道菌群与健康之间的关系。