WGS全基因组测序与分析服务

WGS全基因组测序与分析服务

全基因组测序（Whole Genome Sequencing，简称WGS）是指针对某种生物体的全部基因进行测序，即把生物体细胞内完整的基因组序列从1个DNA分子开始一直到最后一个DNA分子，完完整整地检测出来并按顺序排列好，能检测个体基因组中的全部遗传信息；并且准确性高，其准确率可高达99.99%。使用高通量测序技术分析全基因组可提供所有基因组改变的碱基序列图谱，包括单核苷酸变异（single nucleotide variation,SNV）、插入和缺失（Indels）、 拷贝数变异（copy number

variation,CNV）及结构变异（structure variation,SV）。目前可应用于人类、动植物及微生物，尤其可应用于鉴定遗传疾病、查找驱使肿瘤发展的突变及追踪疾病的暴发等方面。

全基因组测序根据所有基因组改变的碱基序列图谱组装完整程度的不同，又分扫描图测序和完成图测序。

扫描图测序不基于任何参考基因组，构建二代测序PE文库，实测在100X以上数据，组装到scaffolds水平，可以获得基因组中95%以上的序列，98%以上的基因。适合于大样本量的基因组数据挖掘和某类特定基因的数据挖掘。

完成图测序只针对细菌基因组而言，采用二代PE+三代测序的方式，一般100X以上测序量，组装到零gap水平，可以精准地分析细菌基因组的结构组成、质粒、移动单元等。适合于针对实验室重要菌株进行精细化分析，产生的学术影响力也更大，菌株的用途会更广。根据菌株具体信息进行基因组测序组装，保证获得基因组及所含质粒的完整基因组。

纳全生物全基因组测序分析服务，旨在满足用户对单个生物体的整个基因组进行测序和生信分析需求的同时，更便捷帮助用户深入了解生物体的遗传信息，简单的操作，即可解决科研需求的数据信息。

服务流程与内容：

1、订单确认：用户可通过纳全网站或小程序等渠道，获得一对一专属技术顾问，沟通测序需求、测序目的，确认测序方案，下达测序订单。

2、用户送样：根据测序方案，在低温运输条件下，用户寄送符合要求的原始样本或DNA样本。

3、核酸提取与纯化： 用户寄送原始样本的，在接收样本后，提取样本基因组DNA，纯化并质检DNA浓度，保证后续实验DNA质量足够高（无降解，OD260/280=1.8-2.0，总量不少于15μg）。

4、文库构建：扫描图测序利用Covaris进行基因组DNA片段化，完成图测序利用G-tubes方法将基因组DNA 处理成8-10k 的片段；随后构建基因组测序文库。

5、上机测序：按照实验要求，构建好且质量达标的文库，送入高通量基因测序仪进行测序，读取DNA中的碱基序列。

6、生信分析：数据下机后，通过生信分析，获知模板DNA片段的序列，并进行结构基因组学分析、基因预测与功能注释、代谢系统分析、致病系统分析等生息分析流程，获取用户需求的实验数据，并形成覆盖整个测序分析流程的项目报告。

全基因组测序的应用：

病原细菌组学研究： 病原细菌主要包括导致食品腐败、引发人体、畜牧业和养殖业动物感染以及与植物病害相关的各类传染或非传染类的致病细菌。基于全基因组测序的深入比较基因组分析对于研究病原细菌的致病机理、致病相关基因的进化以及筛选新型环保高效的药物靶位点具有不可替代的作用。

环境细菌、古生菌、工业细菌组学研究：环境细菌、古生菌和工业菌主要包括在自然环境生态链中发挥重要作用的一类微生物，如放线菌类、芽孢杆菌类、嗜盐或嗜热等特性的各类古生菌等。全基因组测序在挖掘产能或环境耐受性相关的基因、基因簇、代谢通路和高产或高效能相关基因以及探究植物促生或生物防治相关机理等方面有重要作用。

纳全生物全基因组测序分析服务，为用户提供便捷测序服务流程，专人定制测序方案，无需为如何选择测序而担忧，送样即检、高质量数据，报告即拿即用，科研研究需求数据轻松获取。纳全生物期待为您服务。